Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H3f3cP02301 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H3f3cP02301 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms