Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ComtO88587 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ComtO88587 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ComtO88587 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ComtO88587 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ComtO88587 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ComtO88587 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms