Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops6O88545 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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