Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DffaO54786 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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DffaO54786 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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DffaO54786 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DffaO54786 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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