Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms