Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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