Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Prrt1O35449 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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