Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkd2O35245 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkd2O35245 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2O35245 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2O35245 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms