Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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