Protein–RNA interactions for Protein: O09113

Otp, Homeobox protein orthopedia, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtpO09113 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtpO09113 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtpO09113 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtpO09113 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms