Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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