Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms