Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm8888J3QPX5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm8888J3QPX5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm8888J3QPX5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms