Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm20830J3KML6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Gm20830J3KML6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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