Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pot1bH7BX60 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pot1bH7BX60 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms