Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf148G3X9R7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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