Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScaperF8VQ70 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms