Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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H2-M1F7CXU4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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