Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ednrb-202ENSMUST00000172237 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Dgki-201ENSMUST00000042075 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm43414-201ENSMUST00000197710 3188 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Fmo4-201ENSMUST00000028014 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Parvb-201ENSMUST00000023072 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Gm20538F6Z9R1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms