Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms