Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms