Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms