Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm17333C6EQI3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm17333C6EQI3 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm17333C6EQI3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm17333C6EQI3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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