Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11bB4XVQ1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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