Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Phf11cB4XVP9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Phf11cB4XVP9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Phf11cB4XVP9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Phf11cB4XVP9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms