Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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