Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prrt4B2RU40 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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