Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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