Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms