Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34dA2AGU5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34dA2AGU5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn34dA2AGU5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn34dA2AGU5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34dA2AGU5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms