Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn8Q9Z260 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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