Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cpne6Q9Z140 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms