Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zeb2Q9R0G7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms