Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms