Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phtf1Q9QZ09 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phtf1Q9QZ09 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phtf1Q9QZ09 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms