Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rabgef1Q9JM13 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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