Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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