Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms