Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trem1Q9JKE2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Trem1Q9JKE2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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