Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rb1cc1Q9ESK9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms