Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp29Q9ES63 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp29Q9ES63 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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