Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn4aQ9ER60 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn4aQ9ER60 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms