Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms