Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hmg20aQ9DC33 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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