Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Csnk1dQ9DC28 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms