Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Med27Q9DB40 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Med27Q9DB40 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Med27Q9DB40 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms