Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tmem54Q9D7S1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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