Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Cldn23Q9D7D7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn23Q9D7D7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms