Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syce1Q9D495 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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