Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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